Champ lexical de protéomique
Généralités 19
- protéome
- analyse protéomique
- profil protéomique
- cartographie protéomique
- protéomique comparative
- protéomique quantitative
- protéomique fonctionnelle
- protéomique structurale
- protéomique ciblée
- protéomique non ciblée
- protéomique exploratoire
- protéomique à haut débit
- protéomique shotgun
- protéomique ascendante
- protéomique descendante
- protéomique clinique
- protéomique environnementale
- métaprotéomique
- protéogénomique
Protéines et peptides 20
- protéine
- peptide
- polypeptide
- protéine membranaire
- protéine soluble
- protéine recombinante
- protéine de fusion
- isoforme
- protéine isoforme
- protéforme
- domaine protéique
- motif protéique
- site actif
- site de liaison
- séquence peptidique
- séquence protéique
- fragment peptidique
- masse moléculaire
- poids moléculaire
- point isoélectrique
Préparation des échantillons 20
- échantillon biologique
- préparation d’échantillon
- extraction protéique
- extraction des protéines
- lyse cellulaire
- fractionnement subcellulaire
- enrichissement
- purification
- précipitation des protéines
- déplétion
- digestion enzymatique
- digestion trypsique
- trypsine
- alkylation
- réduction
- désalage
- marquage isotopique
- marquage chimique
- standard interne
- contrôle qualité
Séparation et fractionnement 18
- séparation des protéines
- fractionnement
- électrophorèse
- électrophorèse sur gel
- électrophorèse bidimensionnelle
- gel bidimensionnel
- SDS-PAGE
- focalisation isoélectrique
- chromatographie
- chromatographie liquide
- chromatographie liquide haute performance
- HPLC
- chromatographie d’affinité
- chromatographie d’exclusion stérique
- chromatographie d’échange d’ions
- nanochromatographie
- fraction protéique
- fraction peptidique
Spectrométrie de masse 20
- spectrométrie de masse
- spectromètre de masse
- spectre de masse
- rapport masse sur charge
- ionisation
- ionisation électrospray
- ESI
- MALDI
- MALDI-TOF
- LC-MS
- LC-MS/MS
- MS/MS
- tandem MS
- fragmentation
- ion fragment
- ion précurseur
- temps de rétention
- pic chromatographique
- résolution de masse
- exactitude de masse
Identification et quantification 20
- identification des protéines
- identification peptidique
- spectre peptidique
- empreinte peptidique
- peptide unique
- peptide signature
- couverture de séquence
- recherche en base de données
- score d’identification
- taux de fausses découvertes
- FDR
- quantification
- quantification absolue
- quantification relative
- quantification sans marquage
- label-free
- TMT
- iTRAQ
- SILAC
- spectral counting
Modifications post-traductionnelles 19
- modification post-traductionnelle
- phosphorylation
- glycosylation
- acétylation
- méthylation
- ubiquitination
- sumoylation
- lipidation
- nitrosylation
- oxydation
- clivage protéolytique
- phosphoprotéomique
- glycoprotéomique
- ubiquitinomique
- site de phosphorylation
- site de glycosylation
- protéolyse
- maturation protéique
- signal peptidique
Interactions et réseaux 18
- interactomique
- interactome
- interaction protéine-protéine
- complexe protéique
- réseau d’interactions
- réseau protéique
- co-immunoprécipitation
- immunoprécipitation
- pull-down
- double hybride
- proximité moléculaire
- biotinylation de proximité
- protéine appât
- protéine proie
- partenaire d’interaction
- module fonctionnel
- voie de signalisation
- voie métabolique
Analyse bioinformatique 20
- bioinformatique
- analyse bioinformatique
- annotation fonctionnelle
- annotation protéique
- base de données protéique
- banque de protéines
- alignement de séquences
- homologie
- orthologie
- paralogie
- famille de protéines
- domaine conservé
- motif conservé
- ontologie génique
- enrichissement fonctionnel
- analyse d’enrichissement
- pipeline bioinformatique
- workflow
- reproductibilité
- visualisation de données
Applications 16
- biomarqueur
- marqueur biologique
- signature protéomique
- diagnostic
- pronostic
- médecine personnalisée
- pharmacoprotéomique
- toxicoprotéomique
- protéomique médicale
- protéomique végétale
- protéomique microbienne
- protéomique marine
- protéomique alimentaire
- réponse au stress
- expression protéique
- abondance protéique
Ressources et bases de données 17
- UniProt
- Swiss-Prot
- TrEMBL
- Protein Data Bank
- PDB
- InterPro
- Pfam
- PROSITE
- Reactome
- KEGG
- STRING
- PRIDE
- PeptideAtlas
- Human Protein Atlas
- Mascot
- MaxQuant
- Proteome Discoverer