Ce semble un dérivé irrégulier et plaisant de bourre : mettre les cheveux en désordre comme de la bourre. Scheler est plus disposé à le rattacher à bourrasque.
Étymologie de ébouriffer
L'étymologie de ébouriffer selon le Littré
Émile Littré, Dictionnaire de la langue française, 1872-1877 : l'étymologie telle que la philologie de son temps l'établissait.
Le mot ébouriffer d'après le Littré
v. a. Terme familier. Mettre la coiffure en désordre. S'ébouriffer les cheveux. Lire l'article