Champ lexical de génomique
Notions générales 24
- génome
- science du génome
- analyse génomique
- donnée génomique
- information génomique
- ressource génomique
- séquence génomique
- cartographie génomique
- annotation génomique
- variation génomique
- diversité génomique
- architecture génomique
- organisation du génome
- structure du génome
- taille du génome
- contenu en GC
- génomique structurale
- génomique fonctionnelle
- génomique comparative
- génomique évolutive
- génomique des populations
- génomique environnementale
- génomique médicale
- génomique personnelle
Types de génomes 25
- génome nucléaire
- génome mitochondrial
- génome chloroplastique
- génome plastidial
- génome bactérien
- génome viral
- génome fongique
- génome végétal
- génome animal
- génome humain
- génome de référence
- génome complet
- génome minimal
- génome synthétique
- génome ancestral
- génome haploïde
- génome diploïde
- génome polyploïde
- métagénome
- pangénome
- épigénome
- exome
- transcriptome
- protéome
- métabolome
Éléments et régions du génome 26
- chromosome
- chromatide
- chromatine
- nucléosome
- télomère
- centromère
- locus
- gène
- allèle
- exon
- intron
- promoteur
- enhancer
- amplificateur
- séquence régulatrice
- séquence codante
- séquence non codante
- région intergénique
- cadre de lecture ouvert
- ORF
- CDS
- pseudogène
- famille de gènes
- orthologue
- paralogue
- homologue
ADN, ARN et séquences 24
- ADN
- ARN
- ADN génomique
- ARN messager
- ARN non codant
- ARN ribosomique
- ARN de transfert
- microARN
- ARN interférent
- nucléotide
- base azotée
- paire de bases
- séquence d’ADN
- séquence nucléotidique
- séquence répétée
- séquence palindromique
- microsatellite
- minisatellite
- transposon
- élément transposable
- rétrotransposon
- séquence Alu
- ADN satellite
- ADN mitochondrial
Séquençage et production des données 26
- séquençage
- séquençage de l’ADN
- séquençage du génome
- séquençage complet du génome
- séquençage de l’exome
- séquençage ciblé
- séquençage haut débit
- séquençage de nouvelle génération
- NGS
- séquençage de troisième génération
- séquençage Sanger
- pyroséquençage
- lecture
- paire de lectures
- longue lecture
- lecture courte
- profondeur de séquençage
- couverture
- bibliothèque génomique
- préparation de bibliothèque
- fragmentation
- amplification
- PCR
- capture d’exome
- barcode
- index
Assemblage, annotation et analyse bioinformatique 26
- assemblage de génome
- assemblage de novo
- assemblage guidé par référence
- contig
- échafaudage
- scaffold
- carte génétique
- carte physique
- alignement de séquences
- alignement multiple
- cartographie des lectures
- mapping
- annotation de génome
- annotation fonctionnelle
- prédiction de gènes
- appel de variants
- appel de bases
- contrôle qualité
- filtrage
- pipeline bioinformatique
- format FASTA
- format FASTQ
- format SAM
- format BAM
- format VCF
- base de données génomique
Variation génomique 27
- variant génétique
- variant génomique
- mutation
- mutation ponctuelle
- substitution
- insertion
- délétion
- indel
- polymorphisme
- polymorphisme nucléotidique
- SNP
- SNV
- variant structural
- variation du nombre de copies
- CNV
- inversion
- translocation
- duplication
- réarrangement chromosomique
- haplotype
- haplogroupe
- génotype
- fréquence allélique
- déséquilibre de liaison
- recombinaison
- introgression
- hybridation
Génomique fonctionnelle 22
- expression génique
- régulation génique
- profil d’expression
- transcriptomique
- RNA-seq
- épigénomique
- méthylation de l’ADN
- modification des histones
- accessibilité de la chromatine
- ChIP-seq
- ATAC-seq
- interférence ARN
- silencement génique
- knock-out
- knock-in
- CRISPR
- CRISPR-Cas9
- édition génomique
- édition du génome
- mutagénèse
- mutagénèse dirigée
- phénotypage
Génomique comparative et évolutive 22
- phylogénomique
- synténie
- conservation de séquence
- gène conservé
- gène orthologue
- gène paralogue
- duplication génique
- perte de gène
- transfert horizontal de gènes
- horloge moléculaire
- phylogénie
- arbre phylogénétique
- clade
- distance génétique
- divergence génétique
- sélection naturelle
- sélection positive
- sélection purificatrice
- balayage sélectif
- signature de sélection
- adaptation
- spéciation
Génomique des populations 19
- génétique des populations
- population
- structure génétique
- stratification génétique
- diversité génétique
- variabilité génétique
- flux de gènes
- dérive génétique
- goulot d’étranglement
- effet fondateur
- consanguinité
- panmixie
- admixture
- mélange génétique
- ascendance génétique
- marqueur génétique
- marqueur moléculaire
- génotypage
- imputation génétique
Génomique médicale et humaine 23
- génomique humaine
- médecine génomique
- médecine personnalisée
- médecine de précision
- diagnostic génétique
- test génétique
- conseil génétique
- variant pathogène
- variant probablement pathogène
- variant de signification inconnue
- VSI
- maladie génétique
- maladie rare
- maladie monogénique
- maladie polygénique
- prédisposition génétique
- pharmacogénomique
- oncogénomique
- génomique du cancer
- signature génomique
- biomarqueur
- biobanque
- donnée de santé
Génomique environnementale et métagénomique 22
- métagénomique
- métabarcoding
- barcoding ADN
- ADN environnemental
- ADNe
- microbiome
- microbiote
- diversité microbienne
- écologie microbienne
- taxonomie moléculaire
- amplicon
- séquençage 16S
- ARN ribosomique 16S
- ITS
- shotgun métagénomique
- assemblage métagénomique
- MAG
- génome assemblé à partir de métagénome
- binning
- fonction métabolique
- voie métabolique
- biosurveillance
Génomique agricole, végétale et animale 22
- génomique végétale
- génomique animale
- génomique agricole
- sélection génomique
- amélioration des plantes
- amélioration génétique
- sélection assistée par marqueurs
- QTL
- locus de caractère quantitatif
- GWAS
- étude d’association pangénomique
- caractère quantitatif
- résistance aux maladies
- tolérance à la sécheresse
- domestication
- ressource génétique
- variété
- race
- lignée
- germoplasme
- banque de gènes
- pan-génome
Enjeux, éthique et réglementation 21
- donnée génétique
- donnée personnelle
- donnée sensible
- confidentialité
- consentement éclairé
- discrimination génétique
- vie privée
- anonymisation
- pseudonymisation
- partage des données
- science ouverte
- souveraineté génomique
- biopiraterie
- brevetabilité du vivant
- brevet génétique
- bioéthique
- éthique de la recherche
- recherche à double usage
- biosécurité
- biosûreté
- eugénisme