Champ lexical de écologie microbienne
Dénominations générales 7
- microbiologie environnementale
- biogéographie microbienne
- écophysiologie microbienne
- géomicrobiologie
- biogéochimie
- microbiologie des sols
- microbiologie aquatique
Organismes 13
- micro-organisme
- microbe
- bactérie
- archée
- cyanobactérie
- microalgue
- protiste
- levure
- champignon
- bactériophage
- virus
- procaryote
- eucaryote
Communautés et assemblages 12
- communauté microbienne
- population microbienne
- consortium microbien
- microbiocénose
- microbiote
- microbiome
- virome
- mycobiome
- bactériome
- holobionte
- symbiote
- pathobionte
Habitats et milieux 15
- écosystème microbien
- microhabitat
- niche écologique
- rhizosphère
- phyllosphère
- endosphère
- rhizobiome
- périphyton
- bactérioplancton
- picoplancton
- aéroplancton
- bioaérosol
- sédiment
- interface eau-sédiment
- zone hyporhéique
Biofilms et structures microbiennes 13
- biofilm
- biofilm microbien
- tapis microbien
- matrice extracellulaire
- exopolysaccharide
- floc microbien
- agrégat microbien
- biocroûte
- croûte biologique
- stromatolite
- thrombolithe
- voile bactérien
- neige marine
Interactions écologiques 15
- interaction microbienne
- symbiose
- mutualisme
- commensalisme
- amensalisme
- antagonisme
- compétition
- prédation
- parasitisme
- syntrophie
- coopération
- antibiose
- quorum sensing
- transfert horizontal de gènes
- succession écologique
Métabolismes et cycles biogéochimiques 23
- cycle du carbone
- cycle de l’azote
- cycle du soufre
- cycle du phosphore
- fixation de l’azote
- ammonification
- nitrification
- dénitrification
- anammox
- méthanogenèse
- méthanotrophie
- sulfatoréduction
- réduction du fer
- oxydation du fer
- réduction du manganèse
- fermentation
- respiration anaérobie
- chimiosynthèse
- chimiolithotrophie
- phototrophie
- photosynthèse anoxygénique
- minéralisation
- reminéralisation
Gradients et conditions du milieu 15
- aérobiose
- anaérobiose
- microaérophilie
- anoxie
- hypoxie
- potentiel rédox
- oxycline
- chemocline
- halocline
- thermocline
- zone oxique
- zone anoxique
- salinité
- pH
- oxygène dissous
Stratégies écologiques 11
- copiotrophe
- oligotrophe
- eutrophe
- ubiquiste
- extrêmophile
- acidophile
- alcaliphile
- halophile
- thermophile
- psychrophile
- barophile
Microbiotes et hôtes 13
- microbiote intestinal
- microbiote cutané
- microbiote végétal
- microbiote racinaire
- dysbiose
- endophyte
- épiphyte
- mycorhize
- ectomycorhize
- endomycorhize
- rhizobium
- nodosité
- légumineuse
Méthodes et dispositifs d’étude 14
- colonne de Winogradsky
- microcosme
- mésocosme
- métagénomique
- métatranscriptomique
- métaprotéomique
- métabolomique
- métabarcoding
- séquençage haut débit
- ARN ribosomique 16S
- hybridation in situ en fluorescence
- culture pure
- coculture
- isolement
Applications environnementales 13
- bioremédiation
- biodégradation
- bioaugmentation
- biostimulation
- biofiltration
- lagunage
- boues activées
- digestion anaérobie
- compostage
- biolixiviation
- corrosion microbienne
- pile microbienne
- bioélectrochimie