Champ lexical de microbiote intestinal
Notions générales 25
- flore intestinale
- microbiome intestinal
- microbiote digestif
- flore digestive
- écosystème intestinal
- écosystème microbien intestinal
- communauté microbienne intestinale
- population microbienne intestinale
- microorganisme intestinal
- micro-organisme intestinal
- microorganisme commensal
- micro-organisme commensal
- bactérie commensale
- bactérie bénéfique
- bactérie intestinale
- symbiose
- commensalisme
- mutualisme
- parasitisme
- colonisation intestinale
- résistance à la colonisation
- eubiose
- dysbiose
- santé intestinale
- santé digestive
Microorganismes du microbiote intestinal 25
- bactérie
- archée
- levure
- champignon
- virus
- bactériophage
- phage
- protiste
- bactérie anaérobie
- bactérie aérobie
- bactérie facultative
- bactérie lactique
- bactérie butyrique
- bactérie opportuniste
- lactobacille
- bifidobactérie
- bactéroïde
- clostridie
- entérocoque
- entérobactérie
- colibacille
- streptocoque
- archée méthanogène
- levure commensale
- champignon commensal
Anatomie et milieux digestifs 23
- tube digestif
- appareil digestif
- intestin
- intestin grêle
- duodénum
- jéjunum
- iléon
- côlon
- gros intestin
- cæcum
- rectum
- lumière intestinale
- muqueuse intestinale
- mucus intestinal
- épithélium intestinal
- barrière intestinale
- villosité intestinale
- crypte intestinale
- plaque de Peyer
- selles
- matière fécale
- transit intestinal
- péristaltisme
Écologie intestinale 22
- niche écologique
- habitat microbien
- biofilm
- biofilm intestinal
- communauté microbienne
- interaction microbienne
- compétition microbienne
- exclusion compétitive
- coopération microbienne
- syntrophie
- réseau microbien
- succession microbienne
- colonisation
- colonisation néonatale
- résilience du microbiote
- stabilité du microbiote
- diversité microbienne
- richesse microbienne
- abondance relative
- dominance microbienne
- effet barrière
- pathobionte
Fonctions métaboliques 24
- métabolisme microbien
- fermentation intestinale
- fermentation colique
- fermentation anaérobie
- dégradation des fibres
- fibre alimentaire
- fibre prébiotique
- substrat fermentescible
- acide gras à chaîne courte
- AGCC
- butyrate
- propionate
- acétate
- lactate
- gaz intestinal
- méthane
- hydrogène
- sulfure d’hydrogène
- métabolisme des acides biliaires
- acide biliaire
- synthèse de vitamines
- vitamine K
- vitamine B
- métabolite microbien
Barrière intestinale et immunité 20
- perméabilité intestinale
- hyperperméabilité intestinale
- jonction serrée
- immunité intestinale
- immunité muqueuse
- système immunitaire
- tolérance immunitaire
- immunomodulation
- modulation immunitaire
- lymphocyte T régulateur
- cellule dendritique
- macrophage
- immunoglobuline A
- IgA
- cytokine
- inflammation intestinale
- inflammation de bas grade
- endotoxine
- lipopolysaccharide
- LPS
Dysbiose et déséquilibres 15
- dysbiose intestinale
- déséquilibre du microbiote
- altération du microbiote
- appauvrissement du microbiote
- microbiote appauvri
- microbiote perturbé
- perte de diversité
- diminution de la diversité microbienne
- prolifération bactérienne
- pullulation bactérienne
- pullulation bactérienne de l’intestin grêle
- SIBO
- translocation bactérienne
- dysbiose post-antibiotique
- restauration du microbiote
Pathologies associées 23
- diarrhée
- constipation
- ballonnement
- flatulence
- douleur abdominale
- syndrome de l’intestin irritable
- colopathie fonctionnelle
- maladie inflammatoire chronique de l’intestin
- MICI
- maladie de Crohn
- rectocolite hémorragique
- pouchite
- gastroentérite
- infection intestinale
- colite
- colite infectieuse
- infection à clostridie difficile
- obésité
- diabète
- syndrome métabolique
- allergie
- maladie auto-immune
- cancer colorectal
Alimentation et facteurs d’influence 25
- alimentation
- régime alimentaire
- nutrition
- prébiotique
- probiotique
- synbiotique
- postbiotique
- aliment fermenté
- fermentation alimentaire
- yaourt
- kéfir
- kombucha
- choucroute
- kimchi
- régime occidental
- régime méditerranéen
- régime riche en fibres
- édulcorant
- additif alimentaire
- alcool
- antibiotique
- antibiothérapie
- inhibiteur de la pompe à protons
- IPP
- mode de vie
Naissance, âge et développement 20
- microbiote néonatal
- microbiote infantile
- naissance
- accouchement
- voie basse
- césarienne
- allaitement
- lait maternel
- oligosaccharide du lait humain
- sevrage
- diversification alimentaire
- enfance
- adolescence
- âge adulte
- vieillissement
- personne âgée
- microbiote maternel
- transmission mère-enfant
- fenêtre critique
- développement immunitaire
Probiotiques, prébiotiques et interventions 11
- paraprobiotique
- bactériothérapie
- souche probiotique
- ferment probiotique
- levure boulardii
- complément alimentaire
- aliment fonctionnel
- inuline
- fructo-oligosaccharide
- galacto-oligosaccharide
- modulation du microbiote
Transplantation de microbiote fécal 19
- transplantation de microbiote fécal
- transfert de microbiote fécal
- greffe fécale
- bactériothérapie fécale
- donneur de selles
- receveur
- préparation fécale
- suspension fécale
- banque de selles
- dépistage du donneur
- sélection du donneur
- administration par coloscopie
- administration par sonde
- capsule fécale
- colite récidivante
- restauration de la diversité
- sécurité microbiologique
- risque infectieux
- effet indésirable
Axes intestin-organes 19
- axe intestin-cerveau
- axe microbiote-intestin-cerveau
- axe intestin-foie
- axe intestin-poumon
- axe intestin-peau
- axe intestin-rein
- axe intestin-muscle
- axe intestin-immunité
- neuromédiateur
- sérotonine
- neuro-inflammation
- stress
- anxiété
- dépression
- trouble neurodéveloppemental
- maladie neurodégénérative
- stéatose hépatique
- dermatite atopique
- asthme
Résistome, virome et mycobiome intestinaux 18
- résistome intestinal
- résistome
- gène de résistance
- gène de résistance aux antibiotiques
- antibiorésistance
- transfert horizontal de gènes
- plasmide de résistance
- intégron
- mobilome
- virome intestinal
- virome
- phagome
- mycobiome intestinal
- mycobiome
- mycobiote
- microbiote fongique
- archéome
- protistome
Méthodes d’étude 23
- échantillon fécal
- prélèvement fécal
- prélèvement de selles
- échantillonnage
- culture microbienne
- culture anaérobie
- dénombrement microbien
- unité formant colonie
- UFC
- microscopie
- PCR
- PCR quantitative
- qPCR
- séquençage
- séquençage 16S
- ARN ribosomique 16S
- ARN ribosomique 18S
- ITS
- métabarcoding
- métagénomique
- métatranscriptomique
- métaprotéomique
- métabolomique
Bioinformatique et données omiques 20
- donnée métagénomique
- profil taxonomique
- profil fonctionnel
- richesse spécifique
- diversité alpha
- diversité bêta
- indice de diversité
- unité taxonomique opérationnelle
- OTU
- variant de séquence d’amplicon
- ASV
- annotation fonctionnelle
- binning
- génome assemblé à partir de métagénome
- MAG
- pipeline bioinformatique
- base de données génomique
- analyse multivariée
- signature microbienne
- biomarqueur
Qualité, sécurité et limites d’interprétation 19
- contrôle qualité
- qualité microbiologique
- contamination microbienne
- contaminant
- échantillon contaminé
- biais d’échantillonnage
- biais de séquençage
- variabilité interindividuelle
- variabilité intra-individuelle
- standardisation
- reproductibilité
- corrélation
- causalité
- test du microbiote
- analyse du microbiote
- interprétation biologique
- preuve clinique
- essai clinique
- allégation de santé